Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pnma8aQ80VM8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pnma8aQ80VM8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pnma8aQ80VM8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pnma8aQ80VM8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pnma8aQ80VM8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pnma8aQ80VM8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms