Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Clec18aQ7TSQ1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clec18aQ7TSQ1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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