Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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