Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pram1Q6BCL1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms