Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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