Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Msl2Q69ZF8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Msl2Q69ZF8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Msl2Q69ZF8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Msl2Q69ZF8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Msl2Q69ZF8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msl2Q69ZF8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msl2Q69ZF8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msl2Q69ZF8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msl2Q69ZF8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msl2Q69ZF8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msl2Q69ZF8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msl2Q69ZF8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms