Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Atg9aQ68FE2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9aQ68FE2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms