Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms