Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms