Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms