Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim41Q5NCC3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim41Q5NCC3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms