Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Spire1Q52KF3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Spire1Q52KF3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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