Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms