Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms