Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc4Q3UP24 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc4Q3UP24 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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