Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms