Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp30Q3UN04 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp30Q3UN04 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp30Q3UN04 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp30Q3UN04 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp30Q3UN04 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp30Q3UN04 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp30Q3UN04 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp30Q3UN04 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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