Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms