Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccndbp1Q3TVC7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms