Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rpusd3Q14AI6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms