Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ttc39dQ0VF76 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ttc39dQ0VF76 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ttc39dQ0VF76 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ttc39dQ0VF76 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ttc39dQ0VF76 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ttc39dQ0VF76 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms