Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TrioQ0KL02 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms