Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnnm1Q0GA42 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnnm1Q0GA42 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms