Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Calb2Q08331 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Calb2Q08331 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms