Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sh3bp2Q06649 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bp2Q06649 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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