Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde1bQ01065 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms