Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PrcdQ00LT2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms