Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited1P97769 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms