Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp1P97350 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp1P97350 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp1P97350 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms