Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb13P70321 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb13P70321 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms