Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snrpd1P62315 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snrpd1P62315 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snrpd1P62315 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snrpd1P62315 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snrpd1P62315 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms