Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Dbx1P52950 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Dbx1P52950 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Dbx1P52950 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Dbx1P52950 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Dbx1P52950 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dbx1P52950 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Dbx1P52950 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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