Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms