Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VdrP48281 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VdrP48281 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VdrP48281 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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