Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms