Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddit3P35639 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms