Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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