Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PparaP23204 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms