Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a2P20490 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms