Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Fcer1aP20489 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fcer1aP20489 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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