Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms