Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms