Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms