Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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