Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Me1P06801 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Me1P06801 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Me1P06801 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Me1P06801 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Me1P06801 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Me1P06801 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Me1P06801 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Me1P06801 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Me1P06801 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Me1P06801 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Me1P06801 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Me1P06801 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Me1P06801 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms