Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04219 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04219 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04219 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms