Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P04212 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P04212 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P04212 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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