Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01648 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01648 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms