Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P01641 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01641 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms