Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CopeO89079 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CopeO89079 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CopeO89079 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CopeO89079 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CopeO89079 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CopeO89079 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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